精神病院是個充滿了奇怪住民的仙境，宛如不可思議的世界。總是戴著帽子的帽商、時刻帶著微笑的柴郡貓、對所有人趾高氣昂的女王，還有只能蠕動的毛毛蟲。在這樣一個奇異的國度裡，來了一位喜歡幻想的少女，名叫愛麗絲。 　1889年，英國。當連環殺手「開膛手傑克」正使整個社會陷入恐慌之際，位於倫敦郊外的精神病院裡，愛麗絲和她的朋友們照常過著怪異的日子。某一天，當他們在玩槌球時，一場騷動突然爆發。 「毛毛蟲死了！」 　能夠殺害毛毛蟲的，只有愛麗絲、帽商、柴郡貓和女王四人。愛麗絲驚訝，帽商困惑，柴郡貓微笑，而女王在思索片刻後，莊嚴地說道： 「如果兇手就在我們中間，那麼必須馬上抓住她。要先確定是誰並拘束那個人。」 大家紛紛點頭同意，決定開始討論。

地球曆2873年。隨著地球化技術的發展，人類的居住範圍已經超越了太陽系，人類分散在數十顆星球上生活。定居初期，由於資源爭奪等矛盾不斷，但各個星球的掌權者聚集起來，成立了「人類總議會」，平息了各地的戰爭。目前叛亂行動已經非常少見。 那年的冬天，正在觀測雙子座流星群的天文台發現了流星群中的一條訊息。 「各位人類，晚上好。請來我們的星球。」 這條被認為是來自外太空智慧生命的消息引起了人們的興奮。人類總議會立即成立了外太空探測計劃《雙子座計劃》，並決定派遣宇宙飛船雙子座號前往訊息中所示的坐標。 雙子座號載著冷凍睡眠狀態的乘客和5名船員，繼續向目標地點前進。然而，船內傳來的尖叫聲打破了日常的平靜。趕來的船員發現了背上插著短劍的船長屍體。 船長為何身亡？ 疑雲密布的雙子座號未來將會如何？ 這艘船運載著希望與惡意。

時值元祿，綱吉的治世。 在某個山中的寒村裡，發現了一具遺體。 遺體的情況極其慘烈。從胸部到腹部的身體，被鋸子執拗地破壞。 有人說道： 「〈鋸鬼〉來了吧……。啊，一定是〈鋸鬼〉的所作所為……」 在被持續的雨水封閉的村莊裡，各自的盤算交錯縱橫。