農業から工業へ、手工業から機械へ、各国で産業革命が進む中、目覚ましい発展を遂げているS国。その国と周辺国を繋ぐ内海を渡るのは、S国の技術の結晶である大型客船“メモリア号”だ。 　ある日の船内では、“記憶の宝石”マーダライトの特別展示が行われていた。しかし、出航から数時間後、マーダライトはケースから忽然と姿を消した。 　S国では宝石を狙う神出鬼没の怪盗が時折、世間を騒がせているが、今回の一件は果たして――。 　集められた6人の男女。逃げ場のない船上でそれぞれの思惑が交錯する。 　マーダライトはどこへ消えたのか。そして、この船の行く末は……。

九十九探偵事務所の九十九冬夜（つくもとうや）と一夏希（にのまえなつき）は、とある企業から博士の失踪事件の探査を依頼された。 博士がいた研究施設は彼自身が開発したセキュリティAIに守られていた。 しかし、ある日突然そこから姿を消してしまったのだという。 研究施設にいくつもの謎解きを残して。 探偵たちは制限時間内に、博士が残した謎を全て解き明かすことはできるのだろうか？

新型戦闘機『ゴーストウィング』。 大統領も訪れた空母での最終試験。 着陸態勢に入った戦闘機が轟音と共に爆発炎上した。 上空を旋回する3機の複座（2人乗り）型戦闘機に通信が入る。 『ナイト4は爆発物により大破炎上。大統領は現在消息不明。大統領を狙ったとみられるテロリストが、――君たち6人の中にいる』 犯人だと断定されれば、撃墜（げきつい）される。 一蓮托生（いちれんたくしょう）の話し合いがはじまる――

　人が人を殺す、それが罪にならない時代がわずか数十年前にあった。 　そんな時代に生み出された人間爆弾。特攻隊。「生きたい」と願うことが許されず、「死なないで」と口にすることも憚（はばか）られた。彼らは英雄なのか、犠牲者なのか。現代を生きる４人は彼らに何を伝え、何を学ぶのか。

日本のクライミング聖地と呼ばれる 『灰熊岳(はいぐまだけ)』 登山黎明期(れいめいき)より岩登りが盛んに行われてきた歴史を持つ。 この地で鍛えられた数多(あまた)のアルピニスト(登山家)やクライマーが、世界の秀峰(しゅうほう)や奇岩で活躍してきた。 今日も様々な登攀者(とうはんしゃ)が岩を攀じ登り(よじのぼり)、額に汗をにじませていた。 そんな中、1人の女性が亡くなった。 国内でも指折りのクライマーである彼女がなぜ？ 　これは単なる事故なのか？ 　それとも… ここにいるのはCLIMBER(登攀者)か？ それともCRIMINAL(犯罪者)か？

　世界初の西欧横断鉄道として計画された、寝台列車アーベントラント急行。 　ドイツ帝都ベルリンとスペイン王都マドリードを結ぶ、総長1,300マイルにも及ぶ超長距離路線だ。 　その記念すべき初運行の途上にて、招待されていたマドリード市長の死体が発見された。 　初運行の最中に殺人事件が起きたとなっては、全く以て他国に示しがつかない。後方の一般客に悟られないよう注意しながら、7人は自分たちだけで真相を解き明かすことにした。

悩める少年の前に、彼にそっくりな不思議な男の子が現れました。 その子は、大きな翼を羽搏かせていました。 これは、『あなたを肯定する』物語。

　人が人を殺す、それが罪にならない時代がわずか数十年前にあった。 　そんな時代に生み出された人間爆弾。特攻隊。「生きたい」と願うことが許されず、「死なないで」と口にすることも憚（はばか）られた。彼らは英雄なのか、犠牲者なのか。現代を生きる４人は彼らに何を伝え、何を学ぶのか。

この時代いくつもの国があり、それぞれの国を王が治めていた。 各王たちを支配する皇帝が存在し、皇帝は絶対的な権限をもっている唯一無二の存在だった。 水豊かな国(栄州)には、皇帝が存在した。 国は治安が悪く貧しい為、皆の思惑と欲望が常に満ち溢れていた。 不安になった皇帝は、３人の皇子に仮面をつけて育てることを始めた。 外すことが許されない為、生活は制限される。 そして今日、皇帝が「退任する」と告げた。 ３人の皇子と彼らの許嫁は、皇帝の命により宮廷へ訪れた。

ゼンマイと歯車で動く人型の精密機械である『機巧人形（オートマトン）』と、それを作り出した人間が共存する世界。 優秀な技術を持つエンジニアが集まるオートマトン研究所があった。 そしてその研究所で、ある事件が起きた。 この世界で初めてオートマトンを作った人物が殺され、そのパートナーのオートマトンまでも壊されていたのだ。 重い空気が漂う中、誰からともなく話し合いが始まる。 「「一体、誰がこんなことをしたんだ……？」」