夜、雨の中、馬車は進む。 馬の手綱を握るのはまだ青い剣士。 雨よけのフードの下の顔はどことなく不安げ。 キャビンから漏れる光が二人の影を形取る。 一人は手持ちのハープ、リラを持つ吟遊詩人。 一人は胸元に大きな宝石をたたえる聖女。 聖女は港に向かう。 来たるべき決戦のために。 明日聖女は死する決戦を迎える。 剣士と吟遊詩人は港までの護衛。 ほんの些細な一幕に過ぎない、 しかし剣士と吟遊詩人にとっては 大きな決断と離別の物語。 旅路の先に待つ終わりが、 誰にも知られることなく、 静かに始まろうとしていた。 馬車の影は夜に溶けていく。 雨はただ静かに大地を叩く。 三人の行く末を歌う遠い旋律。

“世界を蝕む見えざる脅威——その名は「ミアズマ」” 目に見えぬ細菌型モンスターが瘴気となり、大地を侵し、人々の命を奪っていく。 Peacefulの教皇がこの予言を下したのは、数年前のことだった。 この言葉を受け、辺境の研究施設にて「特効薬」の開発が始まる。 指揮を執るのは、天才研究者 “所長” 。 そして、ついに特効薬完成の時が迫る中、5人の専門家がこの施設に招かれた。 ——医師、ビール職人、騎士、探検画家、鼠取り。 それぞれが専門分野を活かし、世界を救うために集められたはずだった。 その夜、所長が殺されるまでは。 容疑者は5人。 失われた特効薬のレシピ。 謎に包まれた研究施設の真実。 夜明けまでに、すべてを解き明かし、特効薬を完成させなければならない。 ——さもなくば、ミアズマが世界を滅ぼすだろう。

今から100年前、彼方より隕石が落下。その隕石により空いた穴“The Hole”から“大災の竜”が現れ、世界は滅亡の危機にさらされた。人々が絶望の淵に立たされたその時、特別な力――ジルパワーに目覚めた英雄たちが現れ、世界はかろうじて滅亡を逃れた。 それから100年後……。今も“The Hole”は禍々しくその口を開いている。二度とあの惨劇を起こさぬよう、“The Hole”を塞ぐための調査隊が結成された。彼らが様々な困難を乗り越え、いよいよ明日からは”The Hole”直下の海に出ようとしたその夜のこと。仲間の一人が凄惨な死体となって発見される。 “コロシアム”という密室で行われた殺人 地元住民が目撃した”大災の竜” そして更なる惨劇―― 鍵を握るのは“Re:CALL（リコール）” これは、ジルコンの世界で体験する本格ミステリー。

ブタちゃんを放し飼いにしている商業施設ワンダリングでは、１か月ほど前からブタちゃんが失踪する事件が発生していた。 議長ウィリアム・グローリーと中央情報局局長ヘンリー・マクスウェル、そして協力者のカプリス・ニャオの３名が失踪したブタちゃんの行方を追う。

ある日、４人の冒険者パーティが「ワイバーン討伐」クエストに挑んだ。彼らは危険なワイバーンを討伐し、莫大な報奨金「ジルコイン」を手に入れる寸前までこぎつけたが、その分配をめぐって一歩も譲らず口論となった結果、結論は翌朝に持ち越されることになった。 ところが翌日、その中のひとりが殺害されていた。さらに、死んだ仲間が保管していたはずの「ジルコイン」は丸ごと消え去っている。犯人は誰なのか？そして、消えた「ジルコイン」はどこへ行ったのか？四方を疑心暗鬼に包まれる中、パーティ内に潜む闇が徐々に明らかになってゆく。世界の背景を知らずとも、金と信頼、そして命をめぐる、この謎にあなたは挑むことになるだろう。

オルフィニア大陸でもっとも強い者を決める闘技大会が開催されるとある日。4つの国から代表として選ばれた敗者復活を含む5人の選手が集結した。しかし開会式を目前として、選手控室で1人の選手が殺害された。残された4人は、犯人を探すことを余儀なくされた。闘技大会が始まるまであと1時間しかない。 いったいなぜこの惨劇は起こったのか？闘技大会は無事開催できるのか？

遥か昔から、忌み嫌われ、また畏敬される場所――それが「オニロ島」。 伝えられるところによれば、1度足を踏み入れた者は、2度と帰ってくることの出来ない、禁断の島である。 ある日、不意にその島の周囲を、狂気を孕むかのような嵐が取り巻いた。 嵐は収まることなく、日に日にその勢いを増し、国「フリーダム」へも未曾有の自然災害をもたらす。 この危機を前に、勇気ある者たちが次々と調査隊として派遣されたが、誰一人として帰還を許されなかった。 そして、数多の犠牲の中で、ただ1人――ジーンだけが、帰ってきたのだ。 「オニロ島に、すべての元凶がある。それを壊せば、我々は救われる……」 ジーンの一言で、再び調査隊が結成された。 あなた達は調査隊としてオニロ島を目指す。果たして島にたどり着くことは出来るのか。嵐を止められるのか。

勇気の国「ブレイブ」。 ビールが名産品のこの国で「激ヤバビール」が開発されたという噂が各国を駆け巡った。ブレイブ国女王が最初のひと口をつけたとき、思わず「激ヤバぁ！」と叫んだことからあまりにも美味であることは想像に難（かた）くない。 世界中のビール愛好家はその琥珀色の奇跡を一口飲みたいと、願いを口にし、あるいは行動した。中にはあまりに過激な行為も見受けられ、戦争の火種にもなりかねないと専門家は話した。 本日はその激ヤバビールの試飲会である。女王の名の下に、正統な宴席が設けられたのである。各国は代表者を選任し、激ヤバビールの試飲会に参加を表明した。 代表者となった、責任のある者、あるいはただ幸運だった者。 数奇な機運に誘われたかのように巡り合った参加者たちは、やがて世界を揺るがす大事件に巻き込まれることになる。

年に一度、ジルコンの力の活用した世界中の最先端技術が集結する「ジルコン・シンポジウム」 虹色に輝く空と、８本足の馬に引かれた大型馬車が駆け巡る華やかな会場には、観客たちの興奮と期待に満ち溢れている。最大の見どころは、各国代表の一般参加者による新発明のコンテスト。これまで未来を切り拓く数々の新技術が披露されてきたコンテストに観客の注目が集まる。 しかし、大勢の観客が見守る中、司会者がステージ上で突然倒れてしまう。 参加者たちが持ち込んだ新しい技術が犯行に使われたのか？果たして、事件の真相とは？ ジルコン技術の未来と影。『PROJECT ZIRCON』の世界観で繰り広げられる壮大な謎解きと騙し合いの幕が、今ここに上がる。

オルフィニア大陸の外れ、どこの国にも属さない辺境の谷に、新たな遺跡が発見された。遺跡の奥が純度の高いジルコン鉱脈に繋がっていることが発覚し、一攫千金を狙う採掘者がこぞって遺跡を訪れた。 遺跡の深層にある「極限の間」には、すべてのジルパワーを覆す秘密の力が眠っている……いつしか、そんな噂さえ流れるようになった。 だが、深層を目指した者たちは、相次いで奇怪な死を遂げる。そのうちのひとりはこう言い残した。 「深層に行ってはいけない……アールのせいで、俺たちは……」 「アールの遺跡」と名付けられたこの遺跡の深層に、いったい何があるのか。あなたたちはそれぞれの思いを胸に、遺跡を訪れた……